Герб Специального института НЕРВ - половина фигового листа (символ грехопадения и Древа Познания) и строчка из Роберта Браунинга - God's in His Heaven, All's right with the world (Бог у себя на небе, с миром всё в порядке). Эта организация была создана вскоре после Второго Пришествия на случай появления Ангелов для борьбы с ними. Во главе НЕРВ стоит известный ученый Икари Гэндо, его заместитель - профессор Фуюцуки Кодзё. Начальник научно-исследовательского управления - доктор Акаги Рицуко, начальник оперативного управления - капитан Кацураги Мисато, начальник отдела безопасности неизвестен.

Штаб-квартира НЕРВ была построена в огромной каверне на территории Японии. Подземный комплекс назвали Геофронтом - так именовались проекты подземных городов. Геофронт защищен восемнадцатью слоями броневых плит. В его центре на берегу озера располагается здание штаба - две соприкасающиеся пирамиды, одна направлена вверх, другая - под землю. Над исполинской пещерой разместили целый город - Токио-3, официально построенный для замены современной столицы (Токио-2), но на деле он должен был выполнять функции снабжения и раннего оповещения при появлении Ангела, а также поддерживать ЕВА оружием, энергопитанием и боевым прикрытием. 

Несмотря на номинальные выборы в городской совет, Токио-3 управляется суперкомпьютером НЕРВ под названием МАГИ. Говорят, его разработала мать нынешнего ведущего ученого НЕРВ Акаги Рицуко - доктор Акаги Наоко. Комьютер состоит из трех частей - Валтасара, Мельхиора и Гаспара (по именам трех волхвов, поднесших дары новорожденному Иисусу). Различия между ними очень тонкие - каждый несет матрицу одной из сторон личности Наоко (как ученого, как матери и как женщины). Любое решение должно приниматься консенсусом (единогласно) - как замечает однажды Фуюцуки, весьма демократическая система :-)

Поиском кандидатов в пилоты ЕВА занимается Институт Мардука. Мисато думает, что это независимая организация, отбирающая кандидатов по каким-то техническим критериям.

Командный центр

Огромный зал в штаб-квартире, откуда осуществляется управление всеми системами Токио-3 и стратегическое руководство встреч с Ангелами. Над голографической картой возвышается гигантская лестница, чьи уступы - рабочие места групп операторов, а на вершине - мостике - обычно находятся руководители НЕРВ. 

В персонал мостика входят: лейтенант Аоба Сигэру (связист), лейтенант Макото Хьюга (аналитик), и лейтенант Майя Ибуки (программист).

	Аоба Сигэру Лейтенант, специалист по связи и информационному анализу. Любит играть на гитаре. День рождения - 5 мая. Группа крови А. Туманная личность.
	Макото Хьюга Лейтенант, специалист по связи и информационному анализу. Не прочь похихикать над томиком  манги (японские комиксы), наверное отаку. Носит очки, прической смахивает на Фуюцуки. На протяжении сериала становятся очевидна симпатия Хьюги к Мисато. Ради неё он готов воровать информацию, но при этом старается скрывать свои чувства. Мисато, впрочем, тоже не торопит события.
	Майя Ибуки Старший лейтенант, программистка, ассистент доктора Акаги в работе с центральным вычислительным комплексом. Довольно стеснительна в обращении с мужчинами, зато боготворит свою руководительницу, Рицуко. Майя также очень чувствительна, испытывает отвращение к крови и насилию, что осложняет её работу в НЕРВ.

На самом деле НЕРВ, как и вся ООН, подчиняется Комитету СЭИЛЭ.

Глубоко под пирамидой Штаб-квартиры располагается Конечная Догма - хранилище тайн НЕРВ. Здесь находится центр разработки Проекта Е, где впервые из ДНК Ангела и человеческой души слепили чудовищного Голема - Евангелион. Здесь лаборатория искусственной эволюции, где из ДНК человека и Ангела и из Ангельской души слепили другого Голема - Аянами Рэй. Здесь хранятся "пустые сосуды", глиняные болванки, заготовки для будущий Големов - нерожденные клоны Рэй. Наконец, здесь - последний круг, где в центре замерзающего озера ЛСЛ распят Люцифер этого Ада - Лилит, прародительница человечества.